Espécies de Candida são patógenos oportunistas que podem causar um grande número de infecções, desde mucocutâneas a sistêmicas. No caso de vaginites, sabe-se que mais de 75% das mulheres, já tiveram pelo menos um episódio de candidíase vaginal durante a vida. Os objetivos deste estudo foram (i) caracterizar por parâmetros fenotípicos (produção de exoenzimas e susceptibilidade a antifúngicos) e molecular amostras de Candida albicans obtidas de mulheres com suspeita clinica de candídiase vaginal, atendida no Centro da Referência da mulher na cidade de Aracaju/SE e, (ii) investigar a atividade anti-Candida de óleos essenciais de Lippia gracilis Shauer e Ocimum basilicum L frente a isolados de candidiase vaginal recorrente. A atividade proteolítica e fosfolipídica foi considerada moderada (0,56 ± 0,12 mm e 0,53 ± 0,09 mm, respectivamente) para todos os isolados. A maioria das cepas foram susceptíveis ao fluconazol, voriconazol, nistatina e 5-flucitosina, no entanto, somente uma pequena porcentagem foram susceptiveis a anfotericina B e itraconazol. As isoenzimas MDH (malato desidrogenase) e SDH (sorbitol desidrogenase) mostram forte poder discriminatório intra-específico. A interpretação numérica e genética revelaram poder discriminatório semelhante. A diversidade genética dos isolados foi medida pelas frequencias alélicas e gênicas. Os testes de equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW) mostraram que três loci isoenzimáticos (Adh, Gdh and Sdh-2) não estão em equilíbrio de EHW. O dendograma construído baseado no coeficiente da distância genética de Nei gerou sete grupos; 57,15% (16) dos isolados foram considerados altamente relacionados ou indistiguíveis e 42,85% foram considerados moderadamente relacionados ou não relacioandos. Não foi encontrada relação entre os grupos e as características fenotípicas estudadas. A investigação a atividade anti-Candida dos óleos de L. gracilis Shauer (OELG) e Ocimum basilicum (OEOB) apresentaram como compostos majoritários o carvacrol (42,87%) e o linalol (72,08%), respectivamente. Os ensaios para a determinação da concentração inibitória mínima óleo essencial de OELG e OEOB, nesta ordem, apresentaram faixa entre 48 – 97µg/mL e 0,78 – 1,56mg/mL; os compostos isolados dos respectivos óleos apresentam faixas de CIM 32-65 µg/mL e 5,58 – 11,17mg/mL. Para os dois óleos a cinética de morte das leveduras  demonstrou que as concentrações correspondentes a 1 e 2 x CIM foram fungistáticas. A concentração equivalente a 16 x CIM apresentou efeito fungicida logo 2h após a incubação com eliminação total da população testada. A microscopia eletrônica de transmissão revelou danos ultraestruturais causados pelos óleos essenciais e seus compostos majoritários: ruptura de parede e membrana celular e desorganização do citoplasma. O conjunto de dados produzidos neste estudo aponta para o potencial de utilização dos óleos essenciais de L. gracilis Shauer e O. basilicum para o tratamento de candidíase vaginal recorrente. PALAVRAS-CHAVE: C. albicans, candidíase vaginal, exoenzimas, análise de enzima multilocus, essential oil, anti-Candida, linalol e carvacrol.